1つの商品に複数のSPLL申請番号を設定することはできますか？

1つの商品に複数のSPLL申請番号を設定することはできません。

商品名に複数のSPLL申請番号を記載しても、1つ目のみがSPLL申請番号として認識されます。

そのため、例えば「上巻」と「下巻」といった作品それぞれに個別のSPLL申請番号を申請・取得した場合、1つの商品に複数バリエーションとして登録するのではなく、2つの商品として登録しそれぞれに個別のSPLL申請番号を設定してください。